安平運河為臺南市重要的水岸觀光休閒資源，市長黃偉哲相當重視並責成相關單位積極投入運河改善工作。水利局積極推動污水下水道用戶接管及污水截流工程，已杜絕9成污染來源排入運河。為進一步改善水質，水利局持續向中央爭取經費辦理污水截流工程，減少晴天污水排入運河，維護運河水質。
水利局表示，截流站閘門啟閉皆依據截流水站水位高低SOP規定操作，以保護水資中心正常運作。以近期襲台之山陀兒颱風為例，颱風113年10月4日解除警報，操作廠商即視安平港潮汐低點之時間啟閉截流閘門，將晴天污水引流入水資中心內處理，減低運河污染負荷，穩定運河水質減低異味之影響。
近期操作廠商年度歲修檢視健康截流站聯外管線時，發現該管線老舊恐有破損疑慮，為確保人車通行安全，刻正由該公司辦理老舊污水管線更新作業中，施工期間閘門暫時開啟確保施工安全，預計11月更新完成，屆時將可依據SOP程序正常啟閉閘門。
市長黃偉哲表示，臺南擁有開台歷史的安平港及運河人文故事豐富，是臺南市相當重要文化資產，也是重點觀光發展區域。市府為改善安平運河水質不遺餘力，進一步提升運河水質，打造親水家園。